1866 yılında tüm dünya denizlerde dehşet saçan bir yaratığa dair haberlerle çalkalanmaktadır. Denizlerin güvenliğini tehdit eden bu gizemli yaratığı etkisiz hâle getirmek için bir sefer düzenlenir. Sefere katılan Profesör Aronnax onun sadık hizmetkârı Conseil ve zıpkıncı Ned Land geçirdikleri deniz kazasının ardından kendilerini Kaptan Nemo'nun muhteşem denizaltısı Nautilus'ta bulurlar. Onları eşsiz güzellikteki bu gizemli su altı dünyasında olağanüstü maceralar beklemektedir.